Ao chegar, os prisioneiros passavam por uma triagem em que eram separados os aptos para o trabalho forçado, ou que poderiam interessar às pesquisas médicas no hospital do conjunto, e os não selecionados eram encaminhados diretamente aos "banheiros"
O comandante central dos campos de Auschwitz foi o capitão Rudolf Franz Hoss e o chefe das pesquisas médicas o médico Josef Mengele, este mais tarde refugiado no Brasil onde morreu.